Samurai Sudoku nem egy klasszikus Sudoku játék. A képen látható módon 5 db 9×9 négyzetből álló Sudoku rejtvény van egybe fűzve. A szabályai megegyezik a normás Sudoku játék szabályaival. Összesen 51 féle rejtvény közül lehet választani. 16 db könnyű rejtvény kezdőknek (easy), 18db közepes nehézségű játék haladóknak (medium) és 17db nehéz játék azoknak akik már profi szinten űzik a Sudokut (hard). Számokat beírni úgy lehet, hogy egérrel katt a négyzetre majd az ott megjelenő panelről kiválasztjuk a számot vagy a törlés gombot.